Brief IA : Colossal présente GenoMorph, IA pour 2 300 cibles chez le dodo

Colossal présente GenoMorph, IA pour 2 300 cibles chez le dodo

Brief IA
Tom Levy·3 min

Colossal Biosciences a lancé GenoMorph, une IA capable d'identifier environ 2 300 modifications génétiques à tester pour la dé-extinction du dodo. Cette plateforme utilise des données de développement et des mesures 3D de plus de 70 espèces d'oiseaux, illustrant comment l'IA et la biotechnologie peuvent surmonter les limites des données génétiques dans les projets de dé-extinction.

En bref
1Colossal Biosciences lance GenoMorph, une IA pour identifier les modifications génétiques à tester dans la dé-extinction du dodo
2La plateforme s’appuie sur des données de développement et des mesures 3D de plus de 70 espèces d’oiseaux, et a permis d’isoler environ 2 300 cibles d’édition
3L’entreprise progresse sur les modèles aviaires et reçoit le soutien du fonds NeoGenesis Capital, tout en soulignant la nécessité de validations expérimentales
Pourquoi c'est important — Ces avancées illustrent comment l’IA et la biotechnologie s’articulent pour surmonter les limites des données génétiques dans les projets de dé-extinction.

Colossal Biosciences officialise GenoMorph, une plateforme d’IA qui hiérarchise les gènes à tester pour des espèces disparues aux données rares. L’entreprise avance aussi sur ses modèles aviaires et reçoit un coup de pouce d’un investisseur, avant d’entamer la validation expérimentale des prédictions.

Un appui financier : Peter Diamandis crée NeoGenesis Capital

Peter Diamandis, fondateur de XPRIZE et investisseur de Colossal, a apporté un soutien public aux technologies de l’entreprise. Il a annoncé mercredi la création de NeoGenesis Capital, un fonds destiné à accompagner des sociétés utilisant la plateforme de biologie programmable de Colossal dans la santé, l’agriculture et la conservation. Ce signal intervient alors que, selon Ben Lamm, plusieurs technologies développées en interne commencent à converger et à profiter à d’autres projets au-delà du dodo.

Avancées expérimentales sur les oiseaux modèles

La colonie de pigeons de Nicobar de Colossal compte désormais 36 individus, et l’entreprise indique avoir créé des cellules précurseures des ovules et des spermatozoïdes. Ben Lamm rappelle que ce pigeon, plus proche parent vivant du dodo, fournit des cellules critiques pour générer des oiseaux portant des traits du dodo. L’équipe vise maintenant à valider en laboratoire les prédictions de l’IA. Pour accélérer les essais, Colossal dit avoir mis au point un système à base de nanoparticules lipidiques pour délivrer des outils d’édition génétique directement dans des embryons, afin d’observer l’effet de modifications sans attendre un cycle complet jusqu’à la maturité sexuelle.

Ce que fait GenoMorph et sur quelles données elle s’appuie

Baptisée GenoMorph, la plateforme combine morphologie 3D, génomique comparative et biologie du développement pour proposer des cibles génétiques pertinentes malgré des jeux de données restreints. Pour la concevoir, Colossal a rassemblé des données de développement issues de poules, cailles, canards et pigeons, associées à des informations génétiques et à des mesures 3D de crânes de plus de 70 espèces d’oiseaux. Sa construction a pris plus d’un an et s’appuie sur des travaux antérieurs de dé-extinction. Ben Lamm décrit une IA qui apprend quelles régions de l’ADN s’activent lors de la formation des becs et des structures faciales, afin d’anticiper les commutateurs génétiques impliqués dans l’apparence du dodo. L’outil est présenté comme un moyen de concentrer l’attention sur les différences qui comptent. Environ 2 300 cibles d’édition pour la morphologie crânio-faciale du dodo ont été dégagées pour des tests en laboratoire. Selon Lamm, cela adresse un goulet d’étranglement majeur de la dé-extinction, tout en rappelant que seules des validations expérimentales peuvent déterminer si ces modifications produisent les traits physiques recherchés.

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Données rares, annonce officielle et garde-fous

GenoMorph est déployée sur le cas du dodo où les ressources génétiques sont limitées : Colossal dispose d’un seul génome de dodo, contre 100 pour le mammouth laineux. L’entreprise attribue cet écart aux conditions de conservation, les climats froids préservant mieux l’ADN que les tropiques où vivait le dodo. Ben Lamm souligne plus largement la rareté des génomes complets pour les espèces disparues, qui complique les comparaisons classiques. Colossal a officialisé mercredi l’existence de cette plateforme. Interrogé sur la sûreté, Lamm précise que l’outil n’édite pas des gènes mais aide à sélectionner les changements à étudier, avec l’objectif de rendre l’ingénierie génétique plus précise, plus contrôlée et testable. Il insiste qu’identifier une modification potentielle n’implique ni son introduction immédiate ni une présomption d’innocuité, et que des validations plus fines doivent guider les décisions à chaque étape.

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