Brief IA : L’IA DeepVariant analyse le génome du varech géant en Tasmanie

L’IA DeepVariant analyse le génome du varech géant en Tasmanie

Brief IA
Tom Levy·2 min

L'IA DeepVariant, développée par Google, a été adaptée pour analyser le génome du varech géant en Tasmanie, dont les populations ne représentent plus que 5% de leur niveau historique. Deux génomes de référence ont été publiés et 600 spécimens ont été séquencés sur 40 sites pour préparer des replantations plus tolérantes à la chaleur, dans le cadre de l'Initiative Digital Futures.

En bref
1Les forêts de varech géant en Tasmanie sont réduites à 5% de leur niveau historique
2Deux génomes de référence ont été publiés et DeepVariant a été adapté pour l'analyse génétique
3600 spécimens issus de 40 sites ont été séquencés pour préparer des replantations plus tolérantes à la chaleur
Pourquoi c'est important : Ce projet associe IA et génomique pour restaurer un écosystème marin menacé par le réchauffement climatique.

En Tasmanie, les populations de varech géant ne représentent plus que 5% des niveaux historiques. Google et le CSIRO déploient génomique et IA, via DeepVariant, pour caractériser la diversité du varech et préparer des replantations avec des spécimens plus tolérants à la chaleur, dans le cadre de l’Initiative Digital Futures.

En Tasmanie, il ne reste que 5% des niveaux historiques

Les forêts de varech géant protègent les côtes, servent d'habitat et soutiennent les écosystèmes marins, mais leur disparition s'accélère dans le monde entier à cause du réchauffement des océans. En Tasmanie, ces forêts ne subsistent plus qu'à 5% de leur abondance passée. L'Initiative Digital Futures de Google Australie soutient un effort de restauration, alors que la COP31 débute cette semaine.

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Génomes de référence publiés et DeepVariant entraîné

Deux génomes de référence de grande qualité concernant le varech géant australien ont été rendus publics, constituant un socle pour la génétique de conservation. Les scientifiques ont également modifié l’outil d’intelligence artificielle open source DeepVariant de Google afin d’étudier l’ADN du varech géant.

600 spécimens séquencés sur 40 sites pour guider la replantation

Grâce à DeepVariant, l’ADN de 600 individus sauvages prélevés sur 40 sites le long du littoral tasmanien a pu être séquencé. Google et le CSIRO mènent des travaux de génétique et des expérimentations de croisement en laboratoire afin de restaurer des forêts de varech géant en utilisant des spécimens présentant une diversité génétique et une résistance accrue à la chaleur.

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